Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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