Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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