Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIP4Q15650 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIP4Q15650 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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