Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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PTPRSQ13332 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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PTPRSQ13332 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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PTPRSQ13332 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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PTPRSQ13332 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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PTPRSQ13332 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRSQ13332 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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