Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

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Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SCAPQ12770 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCAPQ12770 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCAPQ12770 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCAPQ12770 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCAPQ12770 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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