Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL3P58215 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL3P58215 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL3P58215 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL3P58215 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL3P58215 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL3P58215 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LOXL3P58215 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL3P58215 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL3P58215 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL3P58215 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL3P58215 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL3P58215 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL3P58215 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LOXL3P58215 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL3P58215 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL3P58215 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL3P58215 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL3P58215 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL3P58215 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL3P58215 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL3P58215 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL3P58215 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL3P58215 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LOXL3P58215 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LOXL3P58215 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LOXL3P58215 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms