Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms