Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf51A6NDU8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms