Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB19A4D1S5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB19A4D1S5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB19A4D1S5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB19A4D1S5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB19A4D1S5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB19A4D1S5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB19A4D1S5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB19A4D1S5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB19A4D1S5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB19A4D1S5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB19A4D1S5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB19A4D1S5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB19A4D1S5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB19A4D1S5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB19A4D1S5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB19A4D1S5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB19A4D1S5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB19A4D1S5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB19A4D1S5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB19A4D1S5 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB19A4D1S5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB19A4D1S5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms