Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms