Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM8A1Q9UBU6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms