Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BATF3Q9NR55 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BATF3Q9NR55 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms