Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 TSPAN9-206ENST00000537971 4284 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 36.1
TBRG4Q969Z0 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 36.1
TBRG4Q969Z0 FNIP2-201ENST00000264433 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.525e-6■■■■■ 36.1
TBRG4Q969Z0 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 36.1
TBRG4Q969Z0 FNIP2-206ENST00000512986 2173 ntTSL 1 (best)10.69□□□□□ -0.75e-6■■■■■ 36.1
TBRG4Q969Z0 RBPMS-206ENST00000519359 839 ntTSL 57.96□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 36.1
TBRG4Q969Z0 SESTD1-203ENST00000428443 10615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 36
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TBRG4Q969Z0 MYO18A-202ENST00000527372 9992 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 36
TBRG4Q969Z0 MYO18A-214ENST00000533112 7522 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 36
TBRG4Q969Z0 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.265e-6■■■■■ 36
TBRG4Q969Z0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.366e-9■■■■■ 36
TBRG4Q969Z0 FAM118A-212ENST00000479180 649 ntTSL 513.94□□□□□ -0.186e-9■■■■■ 36
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TBRG4Q969Z0 FAM118A-214ENST00000483102 657 ntTSL 28.03□□□□□ -1.126e-9■■■■■ 36
TBRG4Q969Z0 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.326e-9■■■■■ 36
TBRG4Q969Z0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.513e-7■■■■■ 35.9
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TBRG4Q969Z0 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 35.9
TBRG4Q969Z0 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.273e-7■■■■■ 35.9
TBRG4Q969Z0 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.333e-7■■■■■ 35.9
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TBRG4Q969Z0 TBL1X-207ENST00000441088 520 ntTSL 36.84□□□□□ -1.313e-7■■■■■ 35.9
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TBRG4Q969Z0 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 35.8
TBRG4Q969Z0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.629e-7■■■■■ 35.8
TBRG4Q969Z0 ITGB5-209ENST00000488466 971 ntTSL 515.72■□□□□ 0.119e-7■■■■■ 35.8
TBRG4Q969Z0 MAGI1-207ENST00000470990 2138 ntTSL 1 (best)7.95□□□□□ -1.144e-6■■■■■ 35.8
TBRG4Q969Z0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 35.7
TBRG4Q969Z0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 35.7
TBRG4Q969Z0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 35.7
TBRG4Q969Z0 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 35.7
TBRG4Q969Z0 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 35.7
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TBRG4Q969Z0 CCNY-207ENST00000490012 793 ntTSL 314.88□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 35.7
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TBRG4Q969Z0 CCNY-204ENST00000374706 3940 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 35.7
TBRG4Q969Z0 CCNY-208ENST00000492478 809 ntTSL 58.91□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 35.7
TBRG4Q969Z0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.214e-7■■■■■ 35.7
TBRG4Q969Z0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.084e-7■■■■■ 35.7
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TBRG4Q969Z0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.644e-7■■■■■ 35.7
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TBRG4Q969Z0 PCGF3-209ENST00000475288 604 ntTSL 317.26■□□□□ 0.354e-7■■■■■ 35.7
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TBRG4Q969Z0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 35.6
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TBRG4Q969Z0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.16e-6■■■■■ 35.5
TBRG4Q969Z0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 35.5
TBRG4Q969Z0 LRP5-206ENST00000529993 5103 ntTSL 1 (best)15.68■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 35.5
TBRG4Q969Z0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 35.4
TBRG4Q969Z0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 35.4
TBRG4Q969Z0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 35.4
TBRG4Q969Z0 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 35.4
TBRG4Q969Z0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.181e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.121e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.081e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.061e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.971e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 GPX4-202ENST00000585362 859 ntTSL 225.61■■□□□ 1.691e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SDCCAG3-203ENST00000371723 865 ntTSL 225.41■■□□□ 1.661e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.661e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.611e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.61e-10■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.551e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.51e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.51e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.411e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.371e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.371e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.361e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PIK3CB-202ENST00000461451 667 ntTSL 223.17■■□□□ 1.31e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 C16orf58-205ENST00000565128 584 ntTSL 422.93■■□□□ 1.261e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 GPX4-211ENST00000614791 431 ntTSL 322.84■■□□□ 1.251e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.231e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.161e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PHLDB3-205ENST00000596902 808 ntTSL 1 (best)22.12■■□□□ 1.131e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PIK3CB-210ENST00000483968 721 ntTSL 321.81■■□□□ 1.081e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 COG3-205ENST00000617325 531 ntTSL 321.79■■□□□ 1.081e-7■■■■■ 35.3
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