Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms