Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms