Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM71E2Q8N5Q1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms