Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF1AQ15573 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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