Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB2Q13425 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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