Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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