Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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