Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM3AP98173 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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FAM3AP98173 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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FAM3AP98173 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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FAM3AP98173 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FAM3AP98173 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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FAM3AP98173 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FAM3AP98173 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FAM3AP98173 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FAM3AP98173 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FAM3AP98173 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FAM3AP98173 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FAM3AP98173 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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