Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARID4AP29374 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID4AP29374 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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