Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EGR1P18146 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EGR1P18146 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EGR1P18146 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR1P18146 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR1P18146 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR1P18146 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR1P18146 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR1P18146 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR1P18146 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR1P18146 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms