Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACAA1P09110 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms