Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms