Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SDHAF3Q9NRP4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms