Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRINP2Q9C0B6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRINP2Q9C0B6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms