Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms