Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MFSD3Q96ES6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms