Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RUFY2Q8WXA3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY2Q8WXA3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY2Q8WXA3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms