Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC63Q8NA47 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms