Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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USP53Q70EK8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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USP53Q70EK8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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USP53Q70EK8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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USP53Q70EK8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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USP53Q70EK8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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USP53Q70EK8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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USP53Q70EK8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP53Q70EK8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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