Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GKAP1Q5VSY0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms