Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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