Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CUL4BQ13620 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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