Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms