Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC26A3P40879 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms