Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms