Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC4Q9Y296 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms