Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
L1RE1Q9UN81 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
L1RE1Q9UN81 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms