Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms