Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF354BQ96LW1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms