Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms