Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms