Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms