Protein–RNA interactions for Protein: Q53RT3

ASPRV1, Retroviral-like aspartic protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASPRV1Q53RT3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ASPRV1Q53RT3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms