Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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DNASE1L3Q13609 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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DNASE1L3Q13609 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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DNASE1L3Q13609 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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DNASE1L3Q13609 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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DNASE1L3Q13609 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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DNASE1L3Q13609 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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DNASE1L3Q13609 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms