Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PEX6Q13608 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PEX6Q13608 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PEX6Q13608 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PEX6Q13608 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEX6Q13608 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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