Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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PTPRJQ12913 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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