Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPCQ01831 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPCQ01831 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPCQ01831 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPCQ01831 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPCQ01831 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPCQ01831 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPCQ01831 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPCQ01831 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPCQ01831 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPCQ01831 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPCQ01831 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPCQ01831 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPCQ01831 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPCQ01831 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPCQ01831 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPCQ01831 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPCQ01831 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPCQ01831 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPCQ01831 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XPCQ01831 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPCQ01831 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPCQ01831 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPCQ01831 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPCQ01831 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPCQ01831 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPCQ01831 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPCQ01831 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPCQ01831 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPCQ01831 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
XPCQ01831 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPCQ01831 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPCQ01831 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
XPCQ01831 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPCQ01831 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPCQ01831 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPCQ01831 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPCQ01831 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPCQ01831 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPCQ01831 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XPCQ01831 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XPCQ01831 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPCQ01831 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPCQ01831 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPCQ01831 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPCQ01831 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPCQ01831 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPCQ01831 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPCQ01831 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPCQ01831 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPCQ01831 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
XPCQ01831 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPCQ01831 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPCQ01831 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPCQ01831 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPCQ01831 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPCQ01831 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XPCQ01831 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XPCQ01831 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XPCQ01831 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XPCQ01831 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XPCQ01831 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XPCQ01831 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XPCQ01831 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XPCQ01831 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
XPCQ01831 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
XPCQ01831 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XPCQ01831 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XPCQ01831 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XPCQ01831 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XPCQ01831 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XPCQ01831 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XPCQ01831 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XPCQ01831 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XPCQ01831 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XPCQ01831 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms